De nombreuses esp?ces montrent des variations cycliques de leurs densit?s. Ces cycles ont un r?le important dans l?mergence de zoonoses en augmentant les contacts entre lHomme et lanimal. Suivant une approche d?cologie de la sant?, jai ?tudi? la communaut? de parasites dune communaut? de rongeurs ? dynamique cyclique afin didentifier les r?servoirs dagents de zoonoses et les parasites potentiellement impliqu?s dans les cycles de cette communaut?. Les r?sultats et les suivis ?pizootiologiques r?alis?s en Franche-Comt? permettent dinf?rer les facteurs de risques biotiques et abiotiques associ?s ? l?mergence de ces zoonoses. Trois agents de zoonoses sont pr?sents: deux hantavirus et le virus Cowpox. La dispersion et le comportement social des rongeurs sont importants pour la transmission de ces virus.